Wird im Plugin ein Namespace verwendet, sollte dieser auch mit auftauchen im Typnamen. Zunächst hatte ich diesen vergessen und wunderte mich warum CreateInstance ständig null zurückliefert.

Assembly ass = Assembly.LoadFrom(file);
string typeName = "ExportExcelPlugin.ExportExcelPlugin";
IPlugin plugin = (IPlugin) ass.CreateInstance(typeName);